W Szkole Podstawowej nr 5324 na warszawskim Targówku obowiązuje nowa zasada – żadnych telefonów. Uczniowie stają się bardziej skupieni i nawet zaczynają czytać lektury. Nie wszyscy są jednak zadowoleni ze zmiany. Cyberprzemo tęskni za światem gier, który wydaje mu się znacznie ciekawszy od szkolnej rzeczywistości.

Pozbawiony dostępu do ekranów Przemek znajduje sprzymierzeńca w panu Batonie, prowadzącym szkolny sklepik. To właśnie dzięki niemu chłopak poznaje nową grę o Darknecie – królowej sieci, która wraz z armią trolli planuje podbić świat. Kiedy dyrektorka odkrywa, że uczeń gra podczas lekcji, próbuje przerwać rozgrywkę. Jest jednak za późno – trolle i boty wydostają się z ekranu i rozpoczynają inwazję na szkołę.

Dyrektorka wraz z uczniami chroni się w bibliotece, gdzie jedyną nadzieją okazuje się najpotężniejszy polski czarnoksiężnik – Pan Twardowski. Rozpoczyna się walka o uratowanie szkoły i książek przed Darknetą oraz jej armią memów, botów i trolli, które próbują przejąć uwagę dzieci.

„Pan Twardowski. Szkoła czarów” w humorystyczny sposób podejmuje temat obecności nowych technologii w życiu najmłodszych, uzależnienia od ekranów oraz rywalizacji cyfrowej rozrywki z książkami i tradycyjnymi formami spędzania czasu. Na scenę powracają znani widzom Rampy pani Marzenka i Cyberprzemo, a elementem inscenizacji są również efekty iluzjonistyczne przygotowane przez Wojciecha Rotowskiego, który wciela się w Mistrza Twardowskiego.